ABSTRACT The local cacao varieties prevalent in the Atlantic Forest region in Bahia, Brazil, have been multiplied by farmers with seedlings produced by the most productive plants. However, these plants have not been evaluated for resistance to Ceratocystis wilt. Thus, in the present study, the resistance levels of different genotypes of local cacao varieties were assessed, aimed at their use in breeding for resistance to this disease. Leaf disks from 119 cacao genotypes, locally named as varieties ‘Common’ (49 genotypes), ‘Maranhão’ (34), and ‘Pará’ (36), were inoculated with Ceratocystis cacaofunesta. Based on the mean number of perithecia formed on those disks, different cacao genetic groups were defined according to the Scott-Knott test. For the three varieties, most genotypes were classified together with the resistance control variety (‘Jaca’), while less than one third of the genotypes were classified together with the susceptible control (CCN51). Therefore, there is variability for resistance to Ceratocystis wilt among the local cacao varieties, and resistant genotypes will be useful in breeding aimed at resistance to this disease.

RESUMO As variedades locais de cacau predominantes na Região de Mata Atlântica na Bahia, Brasil, vêm sendo multiplicadas pelos agricultores a partir de mudas produzidas com sementes das plantas mais produtivas. No entanto, essas plantas não têm sido avaliadas quanto à resistência à Murcha de Ceratocystis. Desta forma, nesta pesquisa, os níveis de resistência de diferentes genótipos de variedades locais de cacaueiro foram avaliados, visando à sua utilização no melhoramento para resistência a essa doença. Discos foliares de 119 acessos de cacaueiro, localmente denominados de variedade Comum (49 acessos), Maranhão (34) e Pará (36), foram inoculadas com Ceratocystis cacaofunesta. Com base no número médio de peritécios formados nesses discos, foram definidos diferentes grupos genéticos de cacau dentre os genótipos testados por meio do teste de Scott-Knott. As três variedades apresentaram a maioria dos genótipos classificados juntamente com a variedade controle de resistência (‘Jaca’), sendo que menos de um terço dos genótipos foram classificados junto com o controle suscetível (CCN51). Conclui-se que há variabilidade para resistência à Murcha de Ceratocystis nas variedades locais de cacau, sendo os genótipos resistentes úteis ao melhoramento visando resistência a essa doença.

ABSTRACT Cacao fruits are agronomically important and show wide variability for several morphological descriptors. The present study aimed to characterize the genetic distance of 51 genotypes of Theobroma cacao L. in the cocoa-producing region of Southern Bahia (Brazil) based on morpho-agronomic descriptors. The inference of genetic similarity was performed from the phenotypic data derived simultaneously from qualitative and quantitative variables, using the Ward-MLM procedure (Modified Location Model) with the SAS® software. The distance matrix was obtained using the Gower logarithmic function. For this, 28 descriptors were evaluated, five qualitative and 23 quantitative. Furthermore, using the likelihood function procedure, the optimal number of groups was five indicating wide variability. Of 23 quantitative descriptors evaluated by fruits and leaves, 95% showed significant differences. The exception was seed width. Groups 1 and 5 were the most distant, while groups 2, 3, and 4 were closest to each other. The greatest difference between increments was 35.32 for the fifth group. The analysis of the first two canonical axes revealed that both represented 81.88% of the variation, with CAN1 and CAN2 responsible for 53.66% and 28.22% of the variation. The most promising genotypes for breeding programs belong to group 5 due to their superior performance for almost all characteristics analyzed.

RESUMO Os frutos de cacau são de grande importância agronômica e apresentam ampla variabilidade em vários descritores morfológicos. O presente estudo teve como objetivo caracterizar a distância genética de 51 genótipos de Theobroma cacao L. na região produtora de cacau do Sul da Bahia (Brasil) com base em descritores morfo-agronômicos. A inferência de similaridade genética foi realizada a partir dos dados fenotípicos derivados simultaneamente de variáveis qualitativas e quantitativas, utilizando o procedimento Ward-MLM (Modified Location Model) com o software SAS®. A matriz de distância foi obtida utilizando a função logarítmica de Gower. Para isso, 28 descritores foram avaliados, cinco qualitativos e 23 quantitativos. Além disso, usando o procedimento de função de verossimilhança, o número ótimo de grupos foi cinco, indicando ampla variabilidade. Dos 23 descritores quantitativos avaliados em frutos e folhas, 95% apresentaram diferenças significativas, exceto a largura da semente. Os grupos 1 e 5 foram os mais distantes, enquanto os grupos 2, 3 e 4 foram mais próximos. A maior diferença entre os incrementos foi de 35,32 para o quinto grupo. A análise das duas primeiras variáveis canônicas representou um total de 81,88% da informação para a distribuição da variação, com CAN1 responsável por 53,66% e CAN2 por 28,22% da variação. Os genótipos mais promissores para programas de melhoramento pertencem ao grupo 5 devido ao seu desempenho superior para quase todas as características analisadas.

Resumo A Cryptomeria japonica é uma conífera, de origem japonesa, com potencial para produção de polpa celulósica, porém pouco se conhece sobre o seu comportamento quando submetida a diferentes cargas de reagentes. Dessa forma, o objetivo do estudo foi avaliar o efeito da carga alcalina nos parâmetros de polpação kraft da madeira de Cryptomeria japonica, visando entender a sua demanda química para obtenção de diferentes níveis de deslignificação. Para isso, utilizou-se a madeira de árvores com 13 anos de idade, que foi caracterizada quanto à densidade básica, composição química e morfologia dos traqueídeos e submetida a curvas de cozimento com diferentes níveis de álcali, variando de 14 a 28%. Após os cozimentos, a polpa e o licor negro obtidos foram avaliados com intuito de entender o efeito da carga alcalina sobre os mesmos. Com base nos resultados obtidos conclui-se que a madeira de Cryptomeria japonica é mais indicada para produção de polpa celulósica de fibra longa não branqueada. Isso devido a sua madeira apresentar alto teor de lignina, que dificulta o processo de deslignificação e baixa densidade básica, que resulta em baixo rendimento. Assim, para otimizar o uso da espécie, é mais indicado trabalhar com polpa celulósica com alto número kappa, a qual é possível aliar um bom rendimento em polpa.

Abstract The Cryptomeria japonica is a conifer, from Japan, with the potential for pulp production, but little is known about their behavior when subjected to different reagent loads. Thus, the objective of the study was to evaluate the effect of the alkaline charge on the kraft pulping parameters of Cryptomeria japonica wood, in order to understand its chemical demand to obtain different delignification levels. For this, we used the wood from trees with 13 years old, which was characterized as to the basic density, chemical composition and tracheids morphology and subjected to cooking curves with different levels of alkali, ranging from 14 to 28%. The pulp and black liquor obtained were evaluated in order to understand the effect of the alkaline charge on them. Based on the results obtained in the cooking curves, applying different alkaline charges, it's concluded that the Cryptomeria japonica wood is more suitable for producing unbleached pulp of long fiber. This is because of its wood present high lignin content, which complicates the delignification process, and low basic density, resulting in low yield. Thus, to optimize the use of this species, it's more indicated to work with pulp with high kappa number, which is possible to combine a good pulp yield.

ABSTRACT Plants of local cacao variety from Southern Bahia were evaluated in order to verify if there are different levels of resistance to witches’ broom disease in the study population and if the evaluation of adult plants in the field is a good predictor of these resistance levels. The seedlings were maintained under greenhouse conditions and inoculated with the fungus Moniliophthora perniciosa. Evaluations of symptoms occurred 60 days after inoculation. In the field, the same genotypes were evaluated by counting the number of dry brooms per plant, per year, and assessing trunk diameter size. The data were subjected to analysis of variance and averages grouped by the Scott–Knott test, differentiated by Tukey’s test and compared by Student’s T test. The Scavina-6 and CCN51 clones as well as the Catongo variety were used as resistance, moderate resistance and susceptibility patterns, respectively. Twenty-eight percent of the genotypes were among the most resistant and the genotypes 4119 and 4033 were considered the most susceptible to the disease in both field and greenhouse evaluations. Field evaluation was promising as a predictor of resistance level. The selected materials presented good characteristics for witches’ broom resistance, with different levels deserving special attention in the context of reducing the vulnerability of Brazilian cacao cultivation to the effects of the disease, especially in the cacao region of Bahia.

Abstract: Eucalyptus is one of the most fast-growing trees. Therefore, in the last decades it has been extensively planted and harvested so that nowadays Eucalyptus is one of the most popular trees of the planet. There are many genres of this plant and they are often treated as a large bunch of the same timber characterized by moderate mechanical and surface properties which hinder their usage for any sight application (e.g. flooring, cladding, ceiling). In this study four species of Eucalyptus: E. grandis, E. dunnii, E. cloeziana and E. tereticornis were undergone to densification through hydro-thermo-mechanical treatment (HTM) first and then to oil heat-treatment (OHT) in order to improve their mechanical properties and hydrophobicity. It was observed that low density species (E. grandis) reaches higher compression degrees while heavier species (E. tereticornis) reach densities over 800 kg/m³; however, HTM decrease the variability of the properties. Treatments at higher temperature (160 °C) involves higher compression degree, lower set-recovery and higher surface hydrophobization, but also weaker mechanical properties. The hot oil post- treatment helps to contain the springback effect and to reduce the wettability of each specimen. Densified samples present similar surface hardness. The tailored application of the two treatments improves the properties of every Eucalyptus which can gain market also for nobler end-usages.

Resumo O objetivo deste estudo foi otimizar e estabelecer um protocolo visando elevar a qualidade e quantidade do ácido desoxirribonucleico (DNA) extraído de folhas, em diferentes estágios de desenvolvimento e conservação, coletadas em plantas adultas e plantas jovens. Além disso, almejou-se padronizar a amplificação via reação de polimerase em cadeia (PCR) e selecionar os marcadores de inter sequência simples repetida (ISSR) de Elaeis guineensis (dendezeiro). O protocolo brometo de cetiltrimetilamônio (CTAB) modificado, devido à suplementação com betamercapto etanol (0,3%) e polivinilpirrolidone (PVP) (3%) no tampão de extração e CTAB 10% com 1,4 M de NaCl a 20 min de incubação, a 650C, resultou em melhorias qualitativas e quantitativas na extração do DNA, mas com variações entre amostras, provavelmente, devido às variações na degradação e estágio de desenvolvimento das folhas. Foram utilizados dois protocolos de PCR (I e II) para a amplificação do DNA, os quais diferiram principalmente com relação à presença de albumina de soro bovino (BSA) e concentração de primer. Não foi realizada a correlação entre amplificação via PCR e qualidade de DNA, obtidos de folhas danificadas ou sadias, mas se observou que a adição de BSA (0,075 mg/mL) e o aumento na concentração de primer (0,5 pcmol) (protocolo II) resultou em bandas mais intensas e distinguíveis, porém se ressalta que a qualidade do DNA foi essencial para uma boa amplificação, considerando-se todas as amostras. A amplificação do DNA com o protocolo II possibilitou a seleção de cinco primers: UBC 807, 810, 812, 834 e 848; os quais foram utilizados para a amplificação de13 famílias, compostas de uma planta parental e oito progênies cada.

Abstract The objective of this study was to optimize and establish a protocol to enhance the quality and quantity of deoxyribonucleic acid (DNA) extracted from leaves under different development stages and conservation conditions collected from mature plants and seedlings. Furthermore, we aimed to standardize the polymerase chain reaction (PCR) and select an inter simple sequence repeat (ISSR) marker for Elaeis guineensis (oil palm). The modified cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) protocol, which used β-mercaptoethanol (0.3%) and polyvinylpyrrolidone (PVP 3%) supplementation in the extraction buffer and 10 % CTAB with 1.4 M NaCl for a 20-min incubation at 65ºC, resulted in improved DNA quality and quantity. However, this protocol presented variable results among samples, probably due to variations in leaf degradation levels and development stages. The two PCR protocols (I and II) for amplifying the DNA, differed mainly in the presence or absence of bovine serum albumin (BSA) and primer concentration. Although, a correlation between PCR amplification and the quality of the DNA extracted from leaves was not established, the addition of BSA (0.075 mg/mL) and the highest primer concentration (0.5 pmol) (protocol II) resulted in more intense and distinguishable bands on gel electrophoresis. DNA quality was essential for a satisfying amplification, considering all the samples. The use of protocol II allowed the selection of five primers: UBC 807, 810, 812, 834, and 848; these were used in the amplification of the DNA extracted from 13 families consisting of one parental plant and eight progenies each.

Resumo No meloeiro (Cucumis melo), a resistência ao Cucumber mosaic virus (CMV) e o conhecimento sobre características reprodutivas são importantes para escolha de genitores de populações de melhoramento. Desta forma, objetivou-se verificar se diferentes acessos de meloeiro em um banco de germoplasma brasileiro possuem resistência ao CMV (estirpe FNY) e polimorfismo, em locos marcadores de resistência, bem como se há diversidade genética quanto à resistência e aos descritores florais e reprodutivos, visando ao melhoramento genético. Os sintomas ocasionados por CMV foram avaliados em 52 genótipos de meloeiro, os quais foram genotipados com três marcadores de polimorfismos de nucleotídeos únicos, relacionados com resistência ao CMV. Uma amostra de 24 genótipos foi caracterizada quanto a descritores florais e reprodutivos. A variação significativa nos níveis de resistência possibilitou classificar os acessos em cinco grupos. Os polimorfismos detectados por meio dos marcadores distribuíram-se de forma independente nesses grupos, consistente com a natureza quantitativa oligogênica da resistência. Houve diferenças significativas entre acessos nos descritores florais e reprodutivos. Por meio da estratégia multivariada Ward-MLM, esses acessos distribuíram-se em sete grupos com características reprodutivas distintas, incluindo-se variabilidade em viabilidade polínica. Portanto, há acessos brasileiros de meloeiro que possuem resistência ao CMV, bem como variabilidade nas características reprodutivas.

Abstract In melon (Cucumis melo) the resistance to Cucumber Mosaic Virus (CMV) and the knowledge about reproductive characteristics are important for selection of genitors for breeding population. So, the objective was to investigate if different accessions of melon from a Brazilian germplasm bank have variability in resistance to CMV (FNY strain) and polymorphism in resistance loci markers, as well as whether there is genetic diversity on resistance and floral morphology descriptors and reproductive biology, aiming at genetic improvement. The symptoms induced by CMV were evaluated in 52 melon genotypes which were genotyped with three markers of single nucleotide polymorphisms related to CMV resistance. A sample of 24 genotypes was characterized for floral and reproductive descriptors. The significant variation in resistance levels allows classifying the accessions in five groups. The polymorphisms detected by the markers were independently distributed in these groups, consistent with the oligogenic quantitative expression of the melon’s resistance. There were significant differences between accessions in floral and reproductive descriptors. Through the Ward-MLM multivariate strategy, these accesses were distributed into seven groups with distinct reproductive characteristics, including variability in pollen viability. Therefore, there are Brazilian accessions of melon that have resistance to CMV, as well as variability in reproductive characteristics.

32 clones de cacau selecionados como resistentes após a epidemia da vassoura-de-bruxa e com destacada produtividade foram caracterizados quanto à diversidade genética e submetidos a nova seleção. Essas plantas foram avaliadas por oito anos na Fazenda Oceania (FO), em Itagibá, BA, Brazil. Os 13 primers microssatélites geraram em média 11,7 alelos (amplicons) por loco, com base nos quais se demonstrou que os 32 clones distribuem-se em grupos distintos dos nove clones utilizados como testemunhas. Os 32 materiais apresentaram diferenças significativas para os caracteres analisados em campo. Dois critérios foram formados pela classificação das plantas mais produtivas e resistentes e utilizados para selecionar plantas dentro dos agrupamentos. Essas plantas selecionadas apresentam potencial para o programa de melhoramento do cacau, possuem elevada produção e alta resistência à vassoura-de-bruxa.

The 32 cacao clones selected as being resistant following the witches’ broom epidemic and for having distinct productivity were characterized according to their genetic diversity and were submitted to a new selection. These plants were assessed for eight years at the Oceania Farm (FO) in Itagibá, Bahia, Brazil. The 13 microsatellite primers generated an average of 11.7 amplicons per locus, and based on them it was demonstrated that the 32 clones distribute themselves in groups apart from the nine clones used as controls. The 32 materials displayed significant differences in relation to the characters assessed in the field. Two criteria were formed from the classification of the most productive and resistant plants, and then used to select plants within the clusters. The selected plants displayed potential for the cacao improvement program, that they have a high production and high resistance to witches' broom.

Zabrotes subfasciatus (Boh.) é estudada intensivamente em termos agronômicos e bioquímicos por causar danos aos grãos de leguminosas armazenados. No entanto, os dados publicados sobre o seu cariótipo são escassos e conflitantes. Assim, o objetivo deste estudo foi descrever o cariótipo e a meiose desse inseto e analisar o padrão de bandas-C de seus cromossomos. Foram analisados os gânglios cerebrais de pré-pupas e os testículos de adultos e pupas com adaptação de uma técnica que permitiu boa qualidade de preparo dos cromossomos dessa espécie. Todos os indivíduos apresentaram 26 cromossomos nas metáfases mitóticas. Esses cromossomos foram classificados em: acrocêntricos (cromossomo X); submetacêntricos (pares 4 e 5); subtelocêntricos (par 12 e cromossomo y); metacêntricos (demais pares). O cromossomo 5 apresentou uma constrição secundária. Todos os cromossomos apresentaram heterocromatina próximo ao centrômero e os cromossomos 5, 9 e X, nos braços longos. O cromossomo X mostrou-se heteropicnótico durante toda a prófase da primeira divisão meiótica. As subfases da prófase I foram pouco distintas e a meiose II de difícil identificação. Os testículos de todos os machos apresentaram poucas células. Os bivalentes apresentaram a forma de bastão na metáfase I. O seu cariótipo constitui-se de 26 cromossomos, sendo as fórmulas cariotípicas 2n = 24 + XX nas fêmeas e 2n = 24 + Xyp e n = 12 + X ou n = 12 + y nos machos.

Zabrotes subfasciatus (Boh.) has been extensively studied in its agronomic and biochemical aspects due to its importance as a damaging insect to leguminous grains during storage. The few cytogenetic studies published on this species yielded conflicting results. In this study, the karyotype was analyzed in order to accurately describe the chromosome C-banding patterns and meiosis. The brain ganglion at the prepupa and the adult and pupal testes were analyzed. All individuals had 26 chromosomes in both brain ganglion and spermatogonic mitotic metaphases. These chromosomes were classified as follows: the 12th pair and the Y chromosome were telocentric; the X chromosome was acrocentric; the 4th and 5th pairs were submetacentric; and the remaining pairs were all metacentric. One of the members of the 5th pair presented a secondary constriction. All chromosomes presented pericentromeric heterochromatin. The large arms of the pairs 5, 9 and X presented heterochromatin. The X chromosome showed to be heteropyknotic throughout the prophase of the first meiotic division. The subphases of prophase I were atypical and meiosis II was rarely identified. Testes of all males showed a few cells; the bivalents were rod-like shaped in metaphase I. Karyological formulae were 2n = 24 + XX in females and 2n = 24 + XYp and either n = 12 + X or n = 12 + Y in males.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de acessos de cacau, selecionados previamente como produtivos e resistentes à vassoura-de-bruxa na Bahia, e estudar suas inter-relações com genótipos no banco de germoplasma. Amostras de DNA de folhas dos 120 acessos, coletados em 17 fazendas de sete municípios do Sul da Bahia, foram amplificadas pela técnica de RAPD ("random amplified polymorphic DNA"). Os coeficientes de dissimilaridade genética, calculados pelo método de Jaccard a partir das bandas RAPD, permitiram evidenciar, pela análise de agrupamento, que a maioria das seleções das fazendas (89,2%) agrupou-se com acessos do banco de germoplasma considerados representativos da diversidade de cacau (híbridos, trinitários, Scavinas, amazônicos e cacau-comum). As demais seleções distribuíram-se em outros sete grupos distintos. Há elevada diversidade genética entre as seleções das fazendas, e algumas delas devem ter-se originado de genitores não incluídos nesta análise. Esses materiais apresentam potencial para seleção de clones com maior diversidade para novos cruzamentos ou uso pelos agricultores.

The objective of this work was to assess genetic diversity of farm cacao accessions, previously selected as productive and resistant to witch broom in Bahia, Brazil, and to study their interrelationship with reference genotypes on germplasm bank. DNA samples from 120 cacao accessions, collected on 17 farms in seven counties in Southern Bahia, were amplified by RAPD technique (random amplified polymorphic DNA). The coefficients of genetic dissimilarity, calculated from the RAPD bands by Jaccard method, allowed to show by cluster analysis that most farm selections (89.2%) grouped with accessions from germplasm bank considered representatives of the cacao genetic diversity (hybrids, Trinitarian, Scavina, Amazon and common cacao). The other selections were distributed in seven distinct groups. There is high genetic diversity among farm selections, and some of them may have originated from other progenitors not included in this analysis. These materials present potential for clone selection with higher diversity for new crossings or direct use by agriculturists.

Os objetivos deste trabalho foram caracterizar a resistência à vassoura-de-bruxa de plantas de cacau originadas do cruzamento entre TSH 1188 e CCN 51 (população segregante), por meio de dois métodos de inoculação em condições de campo, e identificar marcadores microssatélites específicos para grupos de plantas resistentes e suscetíveis. As plantas-controle avaliadas pelos métodos de inoculação natural e inoculação artificial em campo produziram os mesmos padrões de sintomas. As plantas da população segregante também coincidiram os padrões de sintomas em 90%, por esses dois métodos. O método de inoculação artificial em campo permite detectar falso-resistentes. Dos 18 pares de primers microssatélites amplificados, 15 foram polimórficos entre os genitores, e seis entre os grupos de plantas segregantes contrastantes quanto à resistência à vassoura-de-bruxa. Foram confirmadas três marcas previamente associadas a QTL (locos para características quantitativas) relacionados com a resistência à vassoura-de-bruxa, comuns a outras populações. Também foram identificados três novos QTL para esta característica, típicos desta população, o que comprova sua utilidade para o melhoramento genético do cacaueiro.

The objectives of this work were to evaluate cocoa tree resistance against witches'-broom, in plants originated from the crossing between TSH 1188 and CCN 51 (segregating population), by means of two methods of inoculation in field conditions, and to identify microsatellite markers specific for resistant and susceptible plants. The control plants bore identical symptoms as the plants of the segregating population in 90% of the cases under the two methods. The method of artificial inoculation in the field allows the detection of false resistance to the disease. Of the 18 pairs of microsatellite primers amplified, 15 were polymorphic between genitors and six were polymorphic between the two groups of plants evaluated for resistance to witches'-broom. Three previously characterized markers were confirmed as associated to QTL (quantitative trait loci) related to resistance to the witches'-broom, which is common in other populations. Three new QTL for this characteristic, typical of this population, were also identified, which proves the utility of this population for cocoa breeding.

Chenopodium ambrosioides L., conhecida no Brasil por suas propriedades medicinais e usada principalmente para o controle de verminoses intestinais, é pouco estudada quanto à diversidade genética. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de 16 indivíduos de C. ambrosioides, provenientes de diferentes municípios da região cacaueira da Bahia, pela técnica de RAPD (DNA polimórfico amplificado ao acaso). Apenas 6,9% das 216 bandas RAPD amplificadas foram polimórficas e a análise de agrupamento evidenciou que não há formação de grupos por área de coleta. Portanto, há pequena variabilidade entre os materiais e esta variabilidade encontra-se distribuída entre as regiões amostradas.

Chenopodium ambrosioides L. is known in many parts of Brazil for its medicinal properties, mainly used to control intestinal worms. Its genetic diversity is little studied. The objective of this work was to evaluate the genetic variability of 16 accessions of C. ambrosioides from the cocoa region of Bahia State, Brazil, by the RAPD technique (Random Amplified Polymorphic DNA). Only 6.9% of the 216 amplified RAPD bands were polymorphic and the pattern of dispersion of individuals showed no clustering related to sample site. Therefore, there is low variability among accessions and it is distributed among the accessions from the entire sampled region.

O cacaueiro (Theobroma cacao) é alvo de diversas enfermidades, sendo que a podridão-parda, causada por Phytophthora spp. é a principal delas mundialmente. Entretanto, no Brasil, a vassoura-de-bruxa causada por Crinipellis perniciosa, é a mais devastadora. A busca de fontes de resistência às doenças é a etapa básica para programas de melhoramento genético e, nesse sentido, este estudo objetivou caracterizar quantitativamente uma progênie oriunda do cruzamento entre os clones SIC-864 e CCN-51, dois genótipos contrastantes para diversas características, inclusive para resistência à vassoura-de-bruxa e podridão-parda. Foram avaliados em condições de campo o número médio de frutos por planta por ano, porcentagem de frutos sadios, porcentagem de frutos com vassoura-de-bruxa, porcentagem de frutos com podridão-parda, número médio de vassouras vegetativas por planta por ano e número médio de vassouras de almofada floral por planta por ano, durante um período de quatro anos. As estatísticas descritivas da produtividade e da resistência a doenças foram calculadas considerando os valores máximo, médio e mínimo, o desvio padrão, o coeficiente de variação, e a distribuição da freqüência. O coeficiente de repetibilidade foi calculado para estimar a acurácia da variação fenotípica por efeitos ambientais pelos métodos da análise de variância, componentes principais e análise estrutural. Foi demonstrado o caráter segregante dessa progênie para resistência à vassoura-de-bruxa e à podridão-parda e para outras características, mostrando a utilidade da população para estudos de mapeamento genético utilizando marcadores moleculares, visando identificar genes de resistência e "quantitative trait loci" (QTLs) dissimilares dos encontrados no clone Scavina-6, tradicionalmente usado em programas de melhoramento genético do cacaueiro.

Cocoa (Theobroma cacao) is a target for several diseases, the main one being black-pod, caused by Phytophthora spp. However, witches' broom caused by Crinipellis perniciosa is the most devastating cocoa disease in Brazil. The search for sources of disease resistance is the first step in breeding programs. To this end, this study aimed to quantitatively characterize a progeny from the cross between the cocoa clones SIC-864 and CCN-51, two contrastant genotypes for several traits, including resistance to witches' broom and black pod. The progeny was assessed under field conditions for the average number of pods per tree per year, the percentage of healthy pods, the percentage of pods with witches' broom, the percentage of pods with black pod, the average number of vegetative brooms per tree per year and the average number of cushion brooms per tree per year, for a period of four years. The descriptive statistics for productivity and resistance to diseases were computed considering the maximum, the mean and the minimum values, the standard deviation, the coefficient of variation and the distribution of frequency. The repeatability coefficient was computed to estimate the accuracy of the phenotypic measurements through the methods variance analysis, principal components and structural analysis. It was shown that this progeny segregates for resistance to witches' broom, black pod and other traits, thus illustrating its usefulness for studies of genetic mapping using molecular markers, aiming to identify genes of resistance and quantitative trait loci (QTLs) different from those found in the Scavina-6 clone, traditionally used in cocoa breeding programs.

A diversidade genética em cacau (Theobroma cacao L.), embasada em dados morfológicos e em marcadores moleculares, tem sido avaliada com fins de manejo de germoplasma e uso no melhoramento genético. Dados de genealogia de cacau, embora disponíveis, não têm sido utilizados. Foi analisada a diversidade genética em uma amostra de 30 acessos clonais de cacau da série CEPEC, com base em marcadores RAPD e informações de genealogia. Vinte destes acessos são descendentes de TSA-644, material Alto Amazônico, e os dez restantes, derivados de outros cruzamentos envolvendo materiais Amazônicos e Trinitários. Para obtenção dos marcadores RAPD foram utilizados 16 primers e as informações de pedigree obtidas no "International Cocoa Genetic Database". A diversidade genética encontrada foi relativamente baixa, devido ao grande relacionamento genético entre a maioria dos materiais estudados. Verificaram-se nos acessos descendentes de TSA-644 maior diversidade, o que pode ser atribuído à origem deste parental, derivado de um cruzamento entre acessos altamente divergentes. O nível de associação entre similaridades genéticas e coeficientes de paternidade (COP), foi muito baixo, provavelmente devido à homogeneidade do material estudados quanto à genealogia. Os resultados obtidos neste trabalho podem auxiliar na definição de novos cruzamentos para o desenvolvimento de híbridos ou variedades clonais.

Genetic diversity in cocoa (Theobroma cacao L.) has been assessed based on morphological and molecular markers for germplasm management and breeding purposes. Pedigree data is available in cocoa but it has not been used for assessing genetic relatedness. The geneitic diversity of 30 clonal cocoa accessions resistant to witche´ broom disease, from the CEPEC series, were studied on the basis of RAPD data and pedigree information. Twenty of these accessions descend from the TSA-644 clone, originated from a cross between the Upper Amazon germplasm called Scavina-6, the main source of resistance to witches' broom disease, and IMC-67. The ten remaining clones come from different sources including Amazon and Trinitario germplasm. RAPD data was collected using 16 primers and pedigree information was obtained from the International Cocoa Germplasm Database. Genetic similarities, genetic distances and coefficient of parentage were calculated using available software. Relatively low genetic diversity was observed in this germplasm set, probably because of great genetic relatedness amongst accessions studied and the poor representation of the germplasm. The TSA-644 descendants were more diverse than the other accessions used in the study. This might be due to the origin of the TSA clone, which was derived from highly divergent genotypes. Association between genetic similarities based on RAPD data and coefficient of parentage, based on pedigree data, was very low, probably due to the homogeneity of the breeding stocks and poor pedigree information. These findings are useful to cocoa breeders in planning crosses for the development of hybrid and clonal cultivars.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar 154 linhagens endogâmicas recombinantes por meio da avaliação de características quantitativas, morfológicas, moleculares e de resistência a doenças e mapear locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 43 marcadores em nove grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 28 cM, com média de 7,3 cM. Os grupos de ligação variaram em tamanho de 2,3 a 61,2 cM. Os genes de resistência à ferrugem e à antracnose ficaram localizados no mesmo grupo de ligação. Foram mapeados locos associados às oito características quantitativas estudadas, e a explicação da variância fenotípica pelos marcadores variou de 14,03% a 40,14%. Os resultados encontrados lançam bases para o desenvolvimento de mapas específicos saturados e de utilidade em programas de melhoramento do feijoeiro-comum.

The objectives of this work were to characterize 154 recombinant inbred lines of common bean by evaluation of quantitative, morphologic, molecular and disease resistance characteristics and to map quantitative trait loci (QTL) associated to the cycle and production of common bean. Using a LOD score of 4.0 and a recombination frequency of 0.40, 43 markers were mapped into nine linkage groups, covering a total recombination distance of 247.8 cM. The distance between adjacent markers varied between 0 and 28 cM with average of 7.3 cM. The linkage groups size varied between 2.3 and 61.2 cM. The anthracnose and rust resistance genes were mapped in the same linkage group. QTL associated to the eight quantitative characteristics were mapped. The phenotypic variance explained by the QTL varied between 14.03% and 40.14%. The results obtained are the basis for the development of specific saturated maps to be used in common bean programs.